Chosha praecursor: 26 caracteres para decidir el insecto más antiguo

Chosha praecursor: 26 caracteres para decidir el insecto más antiguo#

Un fósil del Carbonífero en Texas, con patas abdominales en forma de remo. De los 58 caracteres anatómicos de la matriz filogenética, Chosha praecursor aporta 26 — y con eso hay que ubicarlo en el árbol de la vida. Este notebook abre el test de topologías, los soportes de clado y la matriz de codificación que el equipo publicó en Zenodo.

El hallazgo: el test de los propios autores rechaza las 3 topologías que sacan a Chosha de Hexapoda (p = 0,0259 / 0,0153 / 0,0146), pero no rechaza la alternativa «hexápodo fuera de Insecta» (p = 0,1945). Por eso el abstract dice strongly favouring y no demonstrates.

Gráfica clave#

Cinco ubicaciones de Chosha puestas a prueba con el test de Shimodaira-Hasegawa

Reproducir#

Abrir en Colab

O localmente:

pip install pandas matplotlib numpy
jupyter execute notebook.ipynb

Datos#

  • datos/test_topologias.csv — 5 hipótesis de ubicación con ln L, Δ ln L, valor p y bandera de rechazo al 5 %

  • datos/caracteres_chosha.csv — los 58 caracteres con nombre, región anatómica, tipo (externa / interna o blanda) y estado codificado en Chosha

  • datos/completitud_taxa.csv — caracteres codificados por cada uno de los 23 taxa (5 fósiles, 18 actuales)

  • datos/soportes_clado_fosil.csv — soporte del grupo de 4 fósiles en 6 análisis (4 bayesianos, 2 de parsimonia)

  • datos/convergencia_mcmc.csv — diagnóstico PSRF y tamaño efectivo de muestra de los 4 análisis bayesianos

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