Memoria inflamatoria en células madre humanas#
¿Una infección que ya pasó deja huella en las células que fabrican tu sangre? El paper trasplantó células madre hematopoyéticas humanas (HSCs) a ratones, las expuso a TNFα o LPS, esperó la recuperación — y encontró dos subpoblaciones. Una de ellas, HSC-iM, conserva una memoria inflamatoria persistente y aparece amplificada en condiciones humanas de estrés medular (hematopoyesis clonal, post-COVID, envejecimiento). El programa llega a la sangre que circula.
El hallazgo: TNFα redujo la frecuencia de HSCs un 55 % y LPS un 69 % (Cohen’s d = 1,9 y 2,5) en xenografts humanos — y las sobrevivientes incluyen una subpoblación con huella inflamatoria que se enriquece +49 % en personas con hematopoyesis clonal (p = 0,017, n = 13).
Gráfica clave#
Reproducir#
O localmente:
pip install pandas matplotlib numpy scipy
jupyter execute notebook.ipynb
Datos#
datos/hsc_frecuencia_inflamacion.csv— 44 mediciones (3 donantes × PBS/TNFα/LPS), frecuencia de HSCs en médula del xenograft tras recuperación (Fig 1g).datos/firma_lthsc_por_subset.csv— 12 filas, score de firma LT-HSC en RNA-seq y ATAC-seq por subset HSC/MPP/LMPP (Fig 2c/2d).datos/clonal_haematopoiesis_hscim.csv— 13 sujetos (4 controles + 9 con CH mutante: 3 TET2, 5 DNMT3A, 1 doble), HSC-iM AUC mediana y fracción de células mutantes en médula (Fig 4h).datos/hscim_sangre_periferica_efectos.csv— 24 contrastes, effect sizes de los programas HSC-I y HSC-iM en sangre periférica de cohortes joven y mayor (Fig 5j).