RNAs que detienen TDP-43

RNAs que detienen TDP-43#

En la ELA y la demencia frontotemporal, una proteína llamada TDP-43 se atasca dentro de las neuronas motoras hasta matarlas. Este paper de Science prueba 17 RNAs cortos como «chaperonas moleculares» — fragmentos que se pegan a TDP-43 y le impiden agregarse. La potencia varía 9× según la secuencia, y el patrón que emerge es más simple de lo que esperarías.

El hallazgo: El número de repeticiones del motivo UG en el RNA predice su potencia chaperona (Spearman ρ = -0,66, p = 0,007, n = 15). Ni el porcentaje UG ni la estabilidad estructural lo hacen.

Gráfica clave#

IC50 vs número de repeticiones UG

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O localmente:

pip install pandas matplotlib numpy scipy
jupyter execute notebook.ipynb

Datos#

  • datos/rna_chaperones_tabla_s1.csv — Tabla S1 del paper: 17 RNAs con IC50, KD, %UG, número de repeticiones UG, ΔG y tipo (natural/engineered/control).