El HIV necesita tocar células para infectarlas

El HIV necesita tocar células para infectarlas#

Los linfocitos T CD4+ en reposo son refractarios al virus libre, pero el HIV se encuentra en ellos en el cuerpo. La diferencia: el contacto célula-célula activa una cascada de señalización que culmina en CDK1 fosforilando nucleoporinas específicas, lo que abre el poro nuclear para la cápside del virus.

El hallazgo: 3,6× más infección con contacto célula-célula que con virus libre. Silenciar CDK1 reduce la infección −33%. De 10 nucleoporinas medidas, solo 3 cambian con el contacto (Nup54 +32%, Nup62 +16%, Tpr +12%).

Gráfica clave#

Cell-free vs cell-cell

Reproducir#

Open In Colab

O localmente:

pip install pandas matplotlib numpy scipy
jupyter execute notebook.ipynb

Datos#

  • datos/cellfree_vs_cellcell.csv — 3 donantes humanos, % T cells CD4+ infectadas en virus libre vs contacto célula-célula (Fig. 1u del paper)

  • datos/knockdown_cdk1.csv — 3 donantes × 3 condiciones (sin tratar, control siRNA, CDK1 silenciado), señal de infección (Fig. 3u)

  • datos/nup_phosphorylation.csv — 10 nucleoporinas × 2 condiciones (+VS, -VS) × ~50 mediciones por condición, intensidad relativa de fosforilación (Fig. 4c)

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