Diseñaron una proteína desde cero. Funcionó en un ratón vivo.

Diseñaron una proteína desde cero. Funcionó en un ratón vivo.#

Tomaron un computador, lo apuntaron a un receptor que vive en la superficie de las células humanas, y le dijeron: hazme una proteína nueva que se pegue a esto y lo active. Lo que salió funcionó — no solo en un tubo de ensayo, también en ratones vivos, moviendo células madre tan bien (o mejor) que el fármaco aprobado por la FDA.

El hallazgo: una miniproteína de ~70 aminoácidos diseñada de novo (sin parecido evolutivo a nada natural) bloquea el receptor CXCR4 al 100 por ciento in vitro a 1 µM, y moviliza células madre hematopoyéticas en ratones con un fold-change mediano de 1.7× respecto al fármaco FDA Mozobil (AMD3100).

Gráfica clave#

Movilización HSC in vivo: control vs AMD3100 vs miniproteína diseñada

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O localmente:

pip install pandas matplotlib numpy scipy
jupyter execute notebook.ipynb

Datos#

Cinco CSVs extraídos del Source Data MOESM3 del paper (Nature):

  • datos/hsc_mobilization_timecourse.csv — 135 mediciones · 9 timepoints (15 min a 72 h) × 3 grupos (Control, AMD3100, dCX1_001) × 5 ratones por punto.

  • datos/hsc_pairwise_stats.csv — comparaciones pareadas del paper (Sidak corregido para 18 comparaciones, con IC al 95 por ciento y p ajustados).

  • datos/cxcr4_antagonism.csv — 96 mediciones in vitro · 8 dosis de CXCL12 × 3 condiciones (sin antagonista, dCX1_001 a 300 nM, dCX1_001 a 1 µM) × 4 réplicas.

  • datos/mrgprx1_dose_response.csv — dosis-respuesta de miniproteínas agonistas en receptor MRGPRX1 (no usado en el análisis principal del notebook).

  • datos/glp1r_gipr_dose_response.csv — dosis-respuesta para GLP1R y GIPR (idem).

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