450 vecinos invisibles dentro de una vaca

450 vecinos invisibles dentro de una vaca#

Los ciliados del rumen — protistas grandes que viven en la panza de vacas, ovejas y otros rumiantes — apenas tenían genomas secuenciados. Este equipo catalogó 450 de un solo golpe (87% nuevos para la ciencia) y conectó la diversidad taxonómica con una organela específica (los hidrogenobodies o HBs) que dispara la metanogénesis.

El hallazgo: 450 genomas eucariotas del rumen, 87% inéditos, y un orden — Vestibuliferida — cargado de la organela que más promueve emisiones de metano.

Gráfica clave#

Tres dominios del rumen, ahora con sus protistas adentro

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O localmente:

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Datos#

  • datos/ciliados_450_metadata.csv — 450 genomas eucariotas con tipo de ensamblaje (SAG/MAG), tamaño, BUSCO completeness, N50, GC% y taxonomía completa.

  • datos/archaea_158.csv — 158 genomas de arqueas del rumen, todas metanógenas, con familia y género.

  • datos/bacteria_phyla_resumen.csv — agregado por phylum de 12.540 genomas bacterianos del rumen.

  • datos/hb_split_ordenes.csv — partición Vestibuliferida vs Entodiniomorphida con etiqueta HB.