Predictores genéticos de pérdida de peso con GLP1

Predictores genéticos de pérdida de peso con GLP1#

27.885 personas tomaron semaglutida o tirzepatida. Una sola variante en el gen GIPR puede triplicar el riesgo de vómitos — pero solo con tirzepatida. Con semaglutida, la misma variante no tiene efecto.

El hallazgo: El genotipo CC de rs1800437 (GIPR) se asocia con 11,8% de prevalencia de vómitos en tirzepatida vs 3,9% del genotipo GG (3,0×, p = 2,2 × 10⁻¹⁰). En semaglutida: CC 9,4% vs GG 9,7% — sin diferencia. Un modelo predictivo que combina clínica + genética mejora la predicción de vómitos (AUC +0,022), pero apenas mueve la predicción de pérdida de peso (ΔR² = 0,001).

Gráfica clave#

Interacción gen-fármaco en efectos secundarios

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O localmente:

pip install pandas matplotlib numpy scipy
jupyter execute notebook.ipynb

Datos#

  • datos/efectos_genotipo.csv — Prevalencia de náusea y vómitos por genotipo GIPR × fármaco (12 filas)

  • datos/resumen_farmacos.csv — Demografía, cambio de IMC y efectos secundarios por fármaco y sexo (14 filas)

  • datos/variantes_gwas.csv — 9 variantes con significancia genómica (índice) de 6 fenotipos

  • datos/modelo_eficacia.csv — Coeficientes del modelo de eficacia (29 predictores)

  • datos/rendimiento_modelo.csv — AUC/R² con y sin genética para 12 fenotipos

  • datos/gwas_peso_cambio.csv — Summary statistics del GWAS de cambio de peso (1.626 variantes, p < 10⁻⁴)

  • datos/gwas_resumen_fenotipos.csv — Resumen de señales GWAS significativas por fenotipo (39 fenotipos)

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