Miles de elementos genéticos mantienen vivo el cáncer

Miles de elementos genéticos mantienen vivo el cáncer#

El ADN extracromosómico (ecDNA) es uno de los mecanismos más temibles del cáncer: cargado de oncogenes, sin centrómero, salta entre células hijas durante la mitosis. Lleva 40 años desconcertando a los biólogos cómo logra hacerlo. Este paper de Nature (2025) lo resuelve: encontró los ganchos.

El hallazgo: 18.487 elementos genéticos en 23 cromosomas humanos — promotores ricos en CpG — que actúan como puntos de anclaje del ecDNA durante la división celular. El 83,5% son específicos a un solo tipo de cáncer; apenas 15 son universales en las 3 líneas analizadas.

Gráfica clave#

Distribución de retention elements por cell line

Reproducir#

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O localmente:

pip install pandas matplotlib numpy
jupyter execute notebook.ipynb

Datos#

  • datos/retention_elements_hg19.csv — 18.487 ventanas genómicas (1.000 pb cada una) con flags binarios de enriquecimiento por cell line. Coordenadas en hg19. Origen: Figshare 30239047.

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