Un mosquito cruzó un océano de ciudades#
Anopheles stephensi no es africano: es un mosquito de malaria asiático que cría en el agua almacenada de las ciudades. Un equipo secuenció 645 genomas completos por África, Medio Oriente y Asia para reconstruir su invasión. Nosotros abrimos su tabla de muestreo —551 mosquitos con país, coordenadas y fecha— y dibujamos la geografía de esa expansión.
El hallazgo: los mosquitos secuenciados se reparten en tres bloques —fuente sudasiática (58), Península Arábiga e Irán (117) y frente africano (376)— con un gradiente de longitud de 72,5 → 55,6 → 37,3 °E: la huella espacial que la reconstrucción genómica del paper lee como el sentido de la invasión.
Gráfica clave#
Reproducir#
O localmente:
pip install pandas matplotlib numpy
jupyter execute notebook.ipynb
Datos#
datos/muestras_stephensi.csv— 551 mosquitos secuenciados; país, coordenadas lat/lon, población de análisis, super-población, fecha de colecta y flag de control de calidad. Rango 2005–2023.
Qué NO reproduce este notebook#
Los genotipos crudos (SNP/CNV) están embargados en ENA/MalariaGEN. Por eso el notebook cubre la geografía y composición del muestreo, no la genética de poblaciones (Fst, admixture) ni las frecuencias de resistencia a insecticidas del paper.
Links#
Video: [Pendiente]
Datos originales: Repositorio AsGARD en Zenodo