Oropouche en Brasil: 9× más casos en un año

Oropouche en Brasil: 9× más casos en un año#

En 2023 Brasil reportó 831 casos confirmados de fiebre Oropouche, casi todos concentrados en la Amazonía. En 2024 fueron 7.931 — repartidos en 27 estados, llegando hasta la costa atlántica. El equipo del CERI-KRISP combinó filogeografía bayesiana con modelado de nicho ecológico para entender la dinámica de la expansión. Este notebook revisita los datos públicos: 8.762 casos individuales del Ministerio de Salud y las velocidades de dispersión estimadas para los tres segmentos del genoma viral.

El hallazgo: El 66% de las velocidades de dispersión inferidas (199 de 300 muestras posteriores) cae por encima del techo del vuelo natural del jején vector — 1.825 km/año en línea recta. El paper enmarca el transporte humano como rol probable (no causación) en saltos largos.

Gráfica clave#

Distribución de velocidades de dispersión del virus vs vuelo natural del vector

Reproducir#

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O localmente:

pip install pandas matplotlib numpy
jupyter execute notebook.ipynb

Datos#

  • datos/casos_semanales.csv — Casos OROV semanales en Brasil 2023-2024 (78 filas, agregado de 8.762 registros SINAN del Ministerio de Salud).

  • datos/casos_por_estado_anio.csv — Casos por estado brasileño y año (38 filas, 11 estados en 2023 → 27 en 2024).

  • datos/occurrence_geographic.csv — Ubicaciones (lon, lat) de detección de OROV en 3 momentos: pre-mid2023 (n=89), pre-2024 (n=133), acumulado 2024 (n=459).

  • datos/dispersal_velocities_by_segment.csv — 300 muestras posteriores de velocidad de dispersión (km/año), 100 por segmento (L, M, S), derivadas de filogeografía bayesiana.